《医宗金鉴》全书包括医学各科共十五种，九十卷。书的内容丰富完备，叙述系统扼要，议论精确，有叙说、有图谱、有验方、有议论，便于学者记诵，力求学以致用，为内、外、妇、儿、眼、伤、针灸各科之完备的巨著，集我国古代医籍文献之大成。其中《订正伤寒论注》十七卷和《订正金匮要略注》八卷为吴谦亲自编注。他在深入研究《伤寒论》、《金匮要略》基础上，参阅了乾隆以前上自三皇下至当朝20余位著名医家的论述和心法要诀，自为删定，修正错误，详审注释。以歌诀的体裁概括疾病诸证的辨证论治理论，切于实际，又易学易用，且阐发了原文的深奥意义，是研究《伤寒》和《金匮》的经典著作之一。

  故清代著名医家徐灵胎评价《医宗金鉴》“此书条理清楚，议论平和，熟读是书。足以名世。”《医宗金鉴》于1742年一经刊行，深受当世与后代中医界的重视，盛赞此书“酌古以准今，芟繁而摘要，古今医学之书，此其集大成矣。”清廷曾将此书作为太医院的必修教材，俞慎初在《中国医学简史》中赞扬《医宗金鉴》为“一部很好的入门书，200年来一直沿用。至今还是医者必备的重要参考文献。”